A forma comum, e talvez a mais antiga, de poluir as águas é pelo lançamento de dejetos humanos e de animais domésticos em rios, lagos e mares. Por serem constituídos de matéria orgânica, esses dejetos aumentam a quantidade de nutrientes disponíveis no ambiente aquático e geralmente ocasionam grande multiplicação de bactérias aeróbicas, que consomem o oxigênio dissolvido na água.
Esse contexto, pode levar ao surgimento de: