A Reforma Protestante teve um importante impacto na geopolítica da Europa, com a perda de influência e fiéis sofrida pela Igreja Católica, além da Guerra dos Trinta Anos (1618- 1648), que opôs reinos protestantes e católicos. Em resposta à crise, a Igreja Católica promoveu uma Contrarreforma que, dentre outros fatores, reativou o Tribunal do Santo Ofício, instituição criada no século XIII com a finalidade de julgar e punir hereges, e que nesse período teve forte apoio das monarquias da Península Ibérica.
Dentre as mais notáveis consequências da Inquisição espanhola e portuguesa estão