O mevalonato, após ser fosforilado apenas 2 vezes e consumindo ATP, é, em seguida, desoxidado, resultando na unidade isoprenoide, isopentenil-pirofosfato. Seis moléculas desse composto serão consumidas para formar esqualeno (30C), a última estrutura linear da via. Essa síntese de esqualeno ocorre graças a reações de hidrolização, carboxilação, redução de AMPc e eliminação de piruvato.