O lapachol (1) é uma naftoquinona isolada de uma fonte natural, o cerne do lenho de árvores conhecidas como ipê. Devido ao seu caráter ácido, o lapachol (1) pode ser prontamente extraído de sua fonte natural quando em contato com uma solução alcalina. Em sua forma ácida, apresenta-se como um sólido de cor amarelada e insolúvel em água, entretanto, o seu sal (base conjugada) apresenta grande solubilidade em água e uma coloração vermelha.
Esquema 1: Formação da beta-lapachona (3) a partir do lapachol (1).
A formação do produto cíclico (3) é bastante favorecida em meio ácido devido à formação de um carbocátion