Os fungos provavelmente evoluíram a partir de ancestrais protistas, e logo no início da evolução teriam surgido duas linhas evolutivas: uma que originou os Chytridiomycota e outra que originou os três grupos de fungos – Zygomycota, Ascomycota e Basidiomycota.
Os Quitrídios conservaram duas características de seus ancestrais que são: